คลิปวิดีโอจากวิทยาลัยการบินพลเรือน ที่ใช้สนามบินมิยาซากิเป็นสนามฝึกนักบิน สามารถบันทึกไว้ได้ในช่วงกลุ่มฝุ่นสีดำพวยพุ่งขึ้นจากพื้นเพียง 2 นาที หลังเครื่องบินผ่านจุดเกิดเหตุในช่วงเช้าวันพุธ (2 ตุลาคม)
กระทรวงคมนาคม เปิดเผยว่า เจ้าหน้าที่พบหลุมระเบิดขนาดเส้นผ่านศูนย์กลาง 7 เมตร และลึก 1 เมตร บนแท็กซีเวย์ หลังเกิดการระเบิดในเวลาราว 8.00 น. ตามเวลาท้องถิ่น และหน่วยเก็บกู้วัตถุระเบิดของกองกำลังป้องกันตนเองได้เข้าตรวจสอบพื้นที่เกิดเหตุ
เที่ยวบินขาเข้าและออกทั้งหมดถูกระงับตั้งแต่เวลา 9.00 น. และสนามบินประกาศว่าจะกลับมาให้บริการตามปกติในเช้าวันพฤหัสบดี หลังซ่อมแซมจุดที่เกิดหลุมขนาดใหญ่
ต่อมาโฆษกรัฐบาล แถลงว่า ระเบิดที่ผลิตโดยสหรัฐฯ เป็นสาเหตุของการระเบิดบนแท็กซีเวย์ และรันเวย์ต้องปิดใช้งาน ส่งผลให้เที่ยวบิน 87 เที่ยวถูกยกเลิก
สนามบินแห่งนี้เคยเป็นฐานทัพอากาศเก่าของกองทัพเรือ และมักพบระเบิดของสหรัฐฯ ที่ยังไม่ระเบิดหลงเหลือมาจากสมัยสงครามโลกครั้งที่ 2 โดยพบระเบิดที่ยังไม่ระเบิด 2 ลูก ที่สนามบินในปี 2554 และอีก 1 ลูก ในปี 2564